Η Λίμνη Μητρικού βρίσκεται σε άμεση σύνδεση με τις λιμνοθάλασσες του νομού Ροδόπης και τη Βιστονίδα, αλλά και γενικότερα με όλους τους υγρότοπους της Θράκης.