Τα νερά της Σαμοθράκης πηγάζουν από το βουνό και προέρχονται από το λιώσιμο των χιονιών ή από υπόγεια ύδατα που βρίσκουν διεξόδους σε διάφορα σημεία του βουνού. Είναι πολύ καθαρά, αφού δεν περνούν από καμμιά εστία μόλυνσης ή ρύπανσης.