Η περιοχή των Κομνηνών βρίσκεται βορειοδυτικά του νομού Ξάνθης και σε απόσταση 5χλμ. βόρεια από το Δήμο Σταυρούπολης. Από την δυτική μεριά του χωριού εκτείνεται η κοιλάδα του ποταμού Νέστου.