Η περιοχή της Γενισέας βρίσκεται 10χλμ. νοτιοανατολικά της πόλης της Ξάνθης, παρακάμπτοντας στο χωριό Βαφέϊκα τον οδικό άξονα Ξάνθης - Πόρτο Λάγους.