Το δέλτα Έβρου βρίσκεται ανατολικά του αεροδρομίου Αλεξανδρούπολης και νοτιανατολικά του εθνικού οδικού και σιδηροδρομικού δικτύου Αλεξανδρούπολης-Ορεστιάδας.

Οδικοί άξονες συνδέουν περιοχές του υγροτόπου με τις κοινότητες Λουτρού, Ανθειας και με τις πόλεις Φερών (οικισμοί Μοναστηράκι, Δορίσκος, Πόρος),Αλεξανδρούπολης (οικισμός Απαλός).