Ο δευτερογενής τομέας στο νομό Έβρου υστερεί σε σχέση με άλλους τομείς. Ο τομέας μεταποίησης συνήθως προσανατολίζεται σε μονάδες που έχουν άμεση σχέση με τον πρωτογενή τομέα. Όμως στην περιοχή του Δέλτα δεν υπάρχουν τέτοιες μονάδες.